Dr. Andreas Keller ist seit 2007 Vorstandsmitglied für Hochschule und Forschung der Gewerkschaft Erziehung und Wissenschaft (GEW), seit 2013 außerdem stellvertretender Vorsitzender. Seit 2012 ist er Vizepräsident des europäischen Dachorganisation der Bildungsgewerkschaften ETUCE.
Davor war er in Forschung und Lehre (Philipps-Universität Marburg), in der Politikberatung (Deutscher Bundestag) und Wissenschaftsmanagement (2003-2006 Charité – Universitätsmedizin Berlin) tätig.
Keller ist Mitglied u.a. des Akkreditierungsrats, der europäischen Bologna Follow-up Group (BFUG), der Kuratorien des Deutschen Studierendenwerks, der Humboldt-Universität zu Berlin und der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg sowie des Aufsichtsrats des Karlsruher Instituts für Technologie (KIT).